以公司名义还是个人名义申请注册商标，最终的是通过审核取得商标注册证书，合法权益均会受到法律保护，且受保护程度是一样的；
商标申请的流程和所需时间、费用也是一样的，都需要经过形式审查、实质审查、公告、发证这些阶段，大概15个月，这个周期是比较长的。
然后说说不同点，个人名义申请的，商标的所有权属于个人，公司名义申请的，商标的所有权属于公司，再者二者准备的材料有差异，以个人名义申请的，还需准备个人的身份证复印件、个体工商户营业执照复印件；
以公司名义申请的，则还需准备营业执照复印件。以个人名义申请的商标，商标持有人对商标享有支配权，但以公司名义申请的商标，公司的实际控制人对商标享有支配权。
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1、个人注册商标与企业注册商标并无本质上的不同。个人注册商标与企业注册商标在商标权的使用上，商标的保护范围等等都是相同的。
2、个人注册商标与企业注册商标的区别在于申请材料的不同：
①个人注册商标需要提供：身证份复印件+个体户营业执照复印件
②企业注册商标需要提供：企业营业执照复印件
商标注册所需时间：商标局大约1个月发出受理通知书，初审公告期3个月，商标注册完成整个时间大约需要1年的时间。
公司名义与个人名义申请商标的相同点
首先，无论以公司名义还是个人名义申请注册商标，只要最终通过审核取得商标注册证书，其合法权益均会受到法律保护，且受保护程度也是一样的；其次，商标申请的流程和所需时间、费用也是一样的，都需要经过形式审查、实质审查、公告、发证这些阶段，从申请到最后拿证预计需要12-14个月；最后，无论以何种名义申请，商标受保护的期限也是一样的，都是10年，如果商标到期后，商标持有人仍需要继续使用，则都需要向商标局申请展期。
公司名义与个人名义申请商标的不同点
首先，商标权的归属不同，个人名义申请的，商标的所有权属于个人，公司名义申请的，商标的所有权属于公司。例如，A公司老板以个人名义持有某商标，从法律角度来说，该商标与A公司无任何关系，且该商标不属于A公司的无形资产。当A公司需要使用该商标时，A公司老板应当与A公司签署商标使用授权书，或者将该商标转让至A公司名下。
其次，二者需准备的资料略有差异。除了都需准备清晰的商标标识和委托书之外，以个人名义申请的，还需准备个人的身份证复印件、个体工商户营业执照复印件；以公司名义申请的，则还需准备营业执照复印件。
再次，二者持有商标的成本可能不同。如果以公司名义申请商标，当公司的名称、注册地址等重要信息发生变更时，公司就应当相应地变更商标信息（商标信息变更的官费为500元/件），否则，有可能对商标的展期造成影响，更严重的是，公司的竞争对手或工商部门有权对未及时变更信息的商标申请撤销。如果以个人名义申请商标，由于个人的姓名和身份证件信息几乎不会发生变化，就可以减少商标信息变更的成本。
最后，商标的支配权不同。以个人名义申请的商标，商标持有人对其享有支配权，但以公司名义申请的商标，则公司的实际控制人对其享有支配权。当公司股东人数较多且利益不一致时，究竟以公司名义还是以个人名义申请注册商标，这是值得商标申请人思考的问题。
注册在个人名下只需要个体工商户营业执照和法人身份证，公司名下需要公司营业执照和委托书。而且注册在公司名下，如果公司注销了，那么商标就要提前转让在个人名下否则就会被注销，而个人名下是不会出现这种情况的
本质上没有区别，个人注册的话，注册人是自然人，要提交身份证和个体工商户营业执照信息；企业注册的话，注册人是法人或其他组织，要提交法人营业执照或者其他主体资格证件还有加盖公章
